תוכנית הלימודים המשותפת לפקולטאות למדעי הטבע, החברה, והחקלאות המזון והסביבה נועדה להכשיר אנשי מדע ומקצוע שידעו להתמודד עם המחסור האובייקטיבי הגלובלי במים שהולך ומחריף בהתמדה. הלימודים הם לתוארי מוסמך ודוקטור. ההכשרה המדעית והמקצועית היא אינטגרטיבית, ועוסקת במגוון תחומי ההידרולוגיה ומשאבי המים. הלימודים יערכו במקביל בירושלים וברחובות, והסטודנטים יצטרכו לנסוע מרחובות לירושלים, או להיפך, לכל היותר ליום אחד בשבוע (במימון האוניברסיטה).